Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3BQ8IVW6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3BQ8IVW6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms