Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDKL3Q8IVW4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDKL3Q8IVW4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms