Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRGAP1Q7Z6B7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP1Q7Z6B7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP1Q7Z6B7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP1Q7Z6B7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP1Q7Z6B7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms