Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRAPPC11Q7Z392 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC11Q7Z392 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms