Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
STRCQ7RTU9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
STRCQ7RTU9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
STRCQ7RTU9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
STRCQ7RTU9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
STRCQ7RTU9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
STRCQ7RTU9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms