Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTF1AQ7RTS3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTF1AQ7RTS3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms