Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUFY3Q7L099 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RUFY3Q7L099 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY3Q7L099 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms