Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRINP3Q76B58 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRINP3Q76B58 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BRINP3Q76B58 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BRINP3Q76B58 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BRINP3Q76B58 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRINP3Q76B58 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRINP3Q76B58 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRINP3Q76B58 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRINP3Q76B58 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BRINP3Q76B58 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRINP3Q76B58 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms