Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PPP1R3FQ6ZSY5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP1R3FQ6ZSY5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms