Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCD1Q6ZMY3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms