Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNI2Q6ZMN8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNI2Q6ZMN8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms