Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM1Q6UX27 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSTM1Q6UX27 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms