Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTR9Q6PD62 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTR9Q6PD62 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTR9Q6PD62 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CTR9Q6PD62 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTR9Q6PD62 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTR9Q6PD62 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CTR9Q6PD62 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTR9Q6PD62 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms