Protein–RNA interactions for Protein: Q6P995

FAM171B, Protein FAM171B, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM171BQ6P995 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM171BQ6P995 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM171BQ6P995 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms