Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD2Q6P5Q4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMOD2Q6P5Q4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms