Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDE2Q6IQ49 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SDE2Q6IQ49 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms