Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A4Q6AI14 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A4Q6AI14 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms