Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNS3Q68CZ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNS3Q68CZ2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms