Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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LRRC38Q5VT99 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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LRRC38Q5VT99 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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LRRC38Q5VT99 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC38Q5VT99 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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LRRC38Q5VT99 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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LRRC38Q5VT99 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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LRRC38Q5VT99 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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LRRC38Q5VT99 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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LRRC38Q5VT99 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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LRRC38Q5VT99 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC38Q5VT99 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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