Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PERM1Q5SV97 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms