Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO47Q5MNV8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO47Q5MNV8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms