Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CEP78Q5JTW2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP78Q5JTW2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms