Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WDR44Q5JSH3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WDR44Q5JSH3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms