Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XKR3Q5GH77 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XKR3Q5GH77 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms