Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGO2Q562F6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGO2Q562F6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms