Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC1Q4ZHG4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC1Q4ZHG4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms