Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP13A4Q4VNC1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP13A4Q4VNC1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms