Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q499Y3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q499Y3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q499Y3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q499Y3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q499Y3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q499Y3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q499Y3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q499Y3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q499Y3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q499Y3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q499Y3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q499Y3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q499Y3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q499Y3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q499Y3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q499Y3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q499Y3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q499Y3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q499Y3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q499Y3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q499Y3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q499Y3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q499Y3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q499Y3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q499Y3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q499Y3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q499Y3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q499Y3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q499Y3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q499Y3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q499Y3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q499Y3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q499Y3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q499Y3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q499Y3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q499Y3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q499Y3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q499Y3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q499Y3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q499Y3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q499Y3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q499Y3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q499Y3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q499Y3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q499Y3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q499Y3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q499Y3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q499Y3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q499Y3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q499Y3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q499Y3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q499Y3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q499Y3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q499Y3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q499Y3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q499Y3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q499Y3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q499Y3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q499Y3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q499Y3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q499Y3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q499Y3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms