Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP41Q3LFD5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP41Q3LFD5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms