Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TWISTNBQ3B726 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TWISTNBQ3B726 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TWISTNBQ3B726 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms