Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC96Q2M329 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC96Q2M329 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms