Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SWI5Q1ZZU3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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