Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNOP1Q1ED39 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNOP1Q1ED39 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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