Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPP1Q16831 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UPP1Q16831 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms