Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMA3Q16787 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMA3Q16787 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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