Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBE2SQ16763 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2SQ16763 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2SQ16763 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2SQ16763 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2SQ16763 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2SQ16763 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2SQ16763 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2SQ16763 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2SQ16763 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2SQ16763 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBE2SQ16763 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms