Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NFIL3Q16649 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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NFIL3Q16649 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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NFIL3Q16649 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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NFIL3Q16649 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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NFIL3Q16649 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFIL3Q16649 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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NFIL3Q16649 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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NFIL3Q16649 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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NFIL3Q16649 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
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NFIL3Q16649 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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NFIL3Q16649 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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NFIL3Q16649 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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NFIL3Q16649 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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NFIL3Q16649 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFIL3Q16649 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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