Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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FXNQ16595 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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FXNQ16595 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FXNQ16595 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FXNQ16595 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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FXNQ16595 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
FXNQ16595 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
FXNQ16595 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FXNQ16595 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FXNQ16595 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FXNQ16595 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FXNQ16595 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FXNQ16595 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
FXNQ16595 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
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FXNQ16595 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FXNQ16595 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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FXNQ16595 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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FXNQ16595 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
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FXNQ16595 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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FXNQ16595 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FXNQ16595 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FXNQ16595 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FXNQ16595 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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FXNQ16595 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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FXNQ16595 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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FXNQ16595 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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FXNQ16595 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FXNQ16595 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FXNQ16595 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FXNQ16595 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FXNQ16595 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FXNQ16595 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FXNQ16595 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FXNQ16595 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FXNQ16595 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FXNQ16595 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FXNQ16595 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FXNQ16595 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FXNQ16595 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FXNQ16595 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FXNQ16595 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FXNQ16595 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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