Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPE65Q16518 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms