Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK5Q16478 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GRIK5Q16478 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK5Q16478 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK5Q16478 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK5Q16478 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK5Q16478 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK5Q16478 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK5Q16478 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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