Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNN3Q15417 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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