Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PUM3Q15397 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PUM3Q15397 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
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