Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDCD1Q15116 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDCD1Q15116 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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