Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RAB39AQ14964 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB39AQ14964 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms