Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPIDRQ14159 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIDRQ14159 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms