Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C1DQ13901 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C1DQ13901 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1DQ13901 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C1DQ13901 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1DQ13901 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1DQ13901 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1DQ13901 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1DQ13901 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1DQ13901 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C1DQ13901 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1DQ13901 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1DQ13901 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1DQ13901 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1DQ13901 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1DQ13901 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C1DQ13901 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1DQ13901 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1DQ13901 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1DQ13901 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1DQ13901 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1DQ13901 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1DQ13901 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1DQ13901 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1DQ13901 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1DQ13901 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1DQ13901 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1DQ13901 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C1DQ13901 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C1DQ13901 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C1DQ13901 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C1DQ13901 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C1DQ13901 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C1DQ13901 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C1DQ13901 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C1DQ13901 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 381.1 ms