Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EXOSC2Q13868 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EXOSC2Q13868 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms