Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPTAN1Q13813 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTAN1Q13813 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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