Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TUBA3CQ13748 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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TUBA3CQ13748 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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TUBA3CQ13748 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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TUBA3CQ13748 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TUBA3CQ13748 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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