Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHAF1AQ13111 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHAF1AQ13111 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
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